Bioinformatica E Genetica Medica 2011/2012

Banche dati di acidi nucleici, proteine, letteratura. Metodi esaustivi ed euristici di allineamento e ricerca di biosequenze in banche dati. Matrici di sostituzione. Allineamenti multipli e profili. Motivi funzionali. Principi di metodi di apprendimento automatico: reti neurali artificiali , catene di Markov e catene nascoste di Markov. Ricerca geni e promotori in genomi. Browser genomici. Annotazione funzionale di geni e genomi. Confronto e classificazione di strutture proteiche. Previsione di struttura secondaria e terziaria in proteine: modelling per omologia, threading, metodi ab initio. Metodi computazionali per l'inferenza delle interazioni molecolari. Metodi integrati. Reti di interazioni proteiche. Banche dati di Interazioni. Ontologie in biologia. Text mining. Esercitazioni pratiche.