Programma di Biologia Molecolare E Bioinformatica:
Struttura degli acidi nucleici, codice genetico, organizzazione di geni e genomil (circa 8 ore). struttura dei cromosomi, nucleosomi; replicazione del DNA: forche di replicazione e origini; repliconi in procarioti ed eucarioti; replicazione discontinua, DNA polimerasi procariotiche ed eucariotiche, controllo della replicazione (circa 8 ore); Trascrizione e sua regolazione: RNA polimerasi e promotori procariotici ed eucariotici, regolazione della trascrizione, fattori, terminazione e antiterminazione, attenuazione (circa 10 ore); Processamento dell'RNA: maturazione dei trascritti, in procarioti ed eucarioti, capping e poliadenilazione, meccanismi di splicing, RNA editing, regolazione della stabilità dei messaggeri, controlli di qualità (circa 8 ore); Traduzione e sue regolazioni: ribosomi, tRNA, amminoacil-sintetasi, regolazioni generali e specifiche, regolazioni traduzionali, microRNA (circa 8 ore). Laboratorio di biologia molecolare: purificazione di un plasmide da coltura batterica, corsa su gel di agarosio, preparazione di soluzioni, uso di bilancia di precisione e spettrofotometro (circa 6 ore).
Banche dati di acidi nucleici, proteine, letteratura. Metodi esaustivi ed euristici di allineamento e ricerca di biosequenze in banche dati. Matrici di sostituzione. Allineamenti multipli e profili (circa 8 ore). Motivi funzionali. Ricerca geni e promotori in genomi. Browser genomici. Annotazione funzionale di geni e genomi. Confronto e classificazione di strutture proteiche. Previsione struttura secondaria e terziaria delle proteine (circa 8 ore). Metodi computazionali per l'inferenza delle interazioni molecolari. Metodi integrati. Reti di interazioni proteiche. Banche dati di Interazioni, pathways, malattie genetiche, SNPs. Ontologie in biologia (circa 8 ore). Esercitazioni pratiche accompagneranno ogni argomento trattato in via teorica.
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