Programma di Bioinformatica

Laurea in Biotecnologie

Prof. Mattia Falconi

Programma

· Il ruolo della Bioinformatica nell’era postgenomica;

· Struttura dell’elaboratore elettronico e delle reti di elaboratori;

· Programmi per accedere alla rete;

· Il sistema operativo UNIX;

· Banche dati biologiche primarie e secondarie;

· Metodi di allineamento delle sequenze di acidi nucleici e di proteine;

· Predizione della struttura secondaria di proteine e di RNA;

· Modelli per omologia;

· Neural Networks e Hidden Markov Models;

· Metodi di riconoscimento di fold,

· Calcoli energetici: minimizzazione dell’energia e dinamica molecolare,

· Procedure di docking.

Il corso prevede esercitazioni su: ricerca ed allineamento di sequenze in banche dati,

uso di programmi freeware di grafica molecolare, modellazione molecolare e docking.