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Biologia Dei Sistemi Computazionale 2019/2020
Programma di Biologia Dei Sistemi Computazionale:
Le lezioni saranno generalmente composte di due parte. Una prima in cui si discuteranno concetti teorici e di una seconda parte in cui questi verranno applicati per lo svolgimento del progetto pratico assegnato. Si farà uso del PC, di programmi preinstallati ed, eventualmente, si scriveranno routine software ad-hoc.
CONTENUTI DELL’INSEGNAMENTO: - Introduzione alla Systems Biology - I sistemi complessi: biologia quantitativa e cenni di simulazione - Teoria dei grafi: formalismi, architettura dei networks biologici, studi topologici - Modellazione/ricostruzione di casi studio partendo da dati biologici reali, analisi e interpretazione dei risultati MATERIALE DIDATTICO: Materiale didattico messo a disposizione dal docente TESTI DI RIFERIMENTO: - Kitano H. Systems biology: a brief overview. Science. 2002 Mar 1;295(5560):1662-4. - M. Hucka, A.. et al. The systems biology markup language (SBML): a medium for representation and exchange of biochemical network models. Bioinformatics, Volume 19, Issue 4, 1 March 2003, Pages 524–531 - Albert-László Barabási, et al. Network Medicine: A Network-based Approach to Human Disease. Nat Rev Genet. 2011 Jan; 12(1): 56–68. - Kwang-Il Goh, et al. The human disease network. PNAS May 22, 2007 104 (21) 8685-8690