Genomica Ed Elementi Di Genetica Statistica 2014/2015

Programma di Genomica ed elementi di genetica statistica A.A. 2014-15

Prof. A. Novelletto

Testo consigliato: Lesk, Introduzione alla Genomica, Zanichelli.

Conoscenze preliminari richieste

Capp.

Fondamenti – Struttura degli acidi nucleici ed espressione genica. Cellule e comunicazione cellula-cellula. I geni nelle famiglie e nelle popolazioni. Amplificazione e ibridazione degli acidi nucleici, clonaggio, metodi di analisi.

Es. Strachan & Read capp.

1

3.1-3.3

4.5

6

Argomenti specifici del corso

Sequenziamento del DNA. Dai metodi classici a quelli di nuova generazione. La filosofia shotgun.

4 e Materiali su didattica-web

Strachan & Read cap. 8

Il genoma umano.

1

Diversita’ del genoma.

Tutorial nei siti web consigliati

Genomica comparata

2

Evoluzione e cambiamenti genomici

3

Genomica funzionale. Microarray, ChIP, DNAse hypersensitive sites

5

Strachan & Read cap. 7

La distribuzione normale, tabelle di contingenza.

Identificazione delle regioni cromosomiche contenenti geni per caratteri quantitativi e complessi

Strachan & Read capp. 3.4,15

Per la parte statistica:

Triola, Triola. Fondamenti di statistica, capp. 2,7 (Pearson ed.)

Withlock, Schluter. Analisi statistica dei dati biologici, cap. 9.1-9.3 (Zanichelli)

Su alcuni argomenti si consiglia di consultare anche Knight, J.C. Human genetic diversity. Oxford Univ. Press.

Siti web da visitare:

http://www.hapmap.org/downloads/index.html.en

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/omim/

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP/

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK174586/

http://hapmap.ncbi.nlm.nih.gov/originhaplotype.html.en

http://hapmap.ncbi.nlm.nih.gov/healthbenefit.html.en

http://www.1000genomes.org/about