Informazioni di Biologia Strutturale Computazionale | DidatticaWEB

Generali:

Dipartimento: Scienze Matematiche, Fisiche E Naturali
Settore Ministeriale: BIO/11
Codice di verbalizzazione: 8067866
Metodi di insegnamento: Frontale
Metodi di valutazione: Orale
Prerequisiti: Nessuno
Obiettivi: �� Richiami di biologia strutturale. �� Esempi di sistemi di riconoscimento molecolare: anticorpo-antigene, enzima-substrato, proteina-DNA (principali motivi di interazione con il DNA, DNA topoisomerasi). �� Caratteristiche strutturali di proteine di membrana e sistemi di predizione associati. �� Metodi sperimentali per la determinazione della struttura delle proteine. �� Banche dati strutturali. Il file PDB. �� I programmi di grafica molecolare Chimera, PyMOL e VMD. �� Metodi computazionali per la predizione delle strutture delle proteine: Homology modelling, threading, ab-initio, basati su IA. �� Analisi di dati di genomica e trascrittomica per l��identificazione di mutazioni proteiche. �� Mapping e modellazione di mutazioni sulle strutture 3D. Il campo di forze FoldX. �� Metodi computazionali per la predizione della struttura degli acidi nucleici. �� Il nuovo metodo Alphafold e RosettaFoldNA per il modelling di complessi proteina-DNA/RNA. �� Metodi computazionali per lo studio di interazioni proteina-proteina, proteina-DNA, proteina-ligando, DNA-ligando. �� Dinamica molecolare classica per lo studio dei moti delle macromolecole biologiche. �� Dinamica molecolare applicata allo studio di sistemi proteina-DNA, proteina-DNA-ligando e aptamero a DNA-ligando. �� Introduzione alla nanotecnologia del DNA.
Ricevimento: LUNEDI' ORE 15-17

Didattica:

A.A.: 2024/2025
Canale: UNICO
Crediti: 6

Classe virtuale:

Nome classe: IACOVELLI-8067866-BIOLOGIA_STRUTTURALE_COMPUTAZIONALE
Link Microsoft Teams: Link
Docente: IACOVELLI FEDERICO