Informazioni di Biologia Computazionale I

Dipartimento: Scienze Matematiche, Fisiche E Naturali
Settore Ministeriale: BIO/10
Codice di verbalizzazione: 8062555
Metodi di insegnamento: Frontale E Altro
Metodi di valutazione: Scritto E Orale
Prerequisiti: nessuno
Obiettivi: Dinamica molecolare classica di proteine ed acidi nucleici Definizione di force field, equazione del moto ed algoritmi di integrazione, scelta del time step, condizioni al contorno, cut-off e lista dei vicini, applicazioni di vincoli, trattamento delle interazioni elettrostatiche. Calcolo di grandezze strutturali, energetiche e dinamiche da simulazioni di Dinamica Molecolare. Esempi di simulazioni di complessi acidi nucleici proteine e di membrane lipidiche. La Dinamica Molecolare su calcolatori paralleli: calcolo delle interazioni di coppia, distribuzione dei dati e loro comunicazione tra i processori, calcolatori a memoria distribuita o condivisa.

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