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Giampiero Mei
Folding, struttura e funzione di metallo. Proteine mediante tecniche di fluorescenza dinamica.
Curriculum Vitae di Giampiero MEI
Posizione Attuale: Professore Ordinario di Biochimica, settore concorsuale 05 BIOS-07 (già 05/E1- ; settore scientifico-disciplinare BIO/10), dal 2021 presso il Dipartimento di Medicina Sperimentale, Università di Roma “Tor Vergata”
Aree d’interesse scientifico:
(i) Spettroscopia UV (assorbanza, dicroismo circolare, infrarosso, fluorescenza, spettroscopia di correlazione di fluorescenza);
(ii) studio del rapporto struttura/funzione di proteine ed enzimi;
(iii) dinamica conformazionale di proteine in soluzione;
(iv) interazione proteine-membrane biologiche;
(v) caratterizzazione degli stati di equilibrio e delle superfici di contatto delle subunità di proteine oligomeriche
Selezione di pubblicazioni scientifiche (10):
Polymorphism on human aromatase affects protein dynamics and substrate binding: spectroscopic evidence. Di Nardo, G., Di Venere, A., Zhang, C., Nicolai, E., Castrignanò, S., Di Paola, L., Gilardi, G., Mei, G. Biol. Direct. (2021) 26; 16(1): 8.
The Odd Faces of Oligomers: The Case of TRAF2-C, A Trimeric C-Terminal Domain of TNF Receptor Associated Factor Di Venere, A., Nicolai, E., Minicozzi, V., Caccuri, A.M., Di Paola, L., and Mei, G. Int. J. Mol. Sci. (2021), 22, 5871 (p. 1-16).
Non-symmetrical structural behavior of a symmetric protein: the case of homo-trimeric TRAF2 (tumor necrosis factor receptor associated factor 2). Minicozzi, V., Di Venere, A., Nicolai, E., Giuliani, A., Caccuri. A.M., Di Paola, L., and Mei, G. J. Biomol. Struct. Dyn. (2021), 39 :319-329.
TNFR-associated factor-2 (TRAF2): not only a trimer. Ceccarelli, A., Di Venere, Nicolai, E., A., De Luca, A., Minicozzi, V., Rosato, N., Caccuri, A.M., and Mei, G. Biochemistry (2015) 54(40): 6153-6161.
Probing conformational changes in lipoxygenases upon membrane binding: Fine-tuning by the active site inhibitor ETYA
Di Venere, A., Nicolai, E., Ivanov, I., Dainese, E., Adel, S., Angelucci, B.C., Hartmut Kuhn, H., Maccarrone, M., Mei, G. Biochim. Biophys. Acta (2014), 1841: 1–10.
A novel role for iron in modulating the activity and membrane-binding ability of a trimmer soybean lipoxygenase. Dainese, E., Angelucci, C.B., Sabatucci, A., De Filippis, V., Mei, G., Maccarrone, M. FASEB J. (2010), 24: 1725-1736.
Structural properties of plant and mammalian lipoxygenases. Temperature-dependent coformational alterations and membrane binding ability.Mei, G., Di Venere, A., Nicolai, E., Angelucci, C.B., Ivanov, I., Sabatucci, A., Dainese, Kuhn, E.H. and Maccarrone, M. Biochemistry (2008), 47(35): 9234-9242.
The importance of being dimeric. Mei, G., Di Venere, A., Rosato, N., and Finazzi Agro’, A. FEBS J. (2005), 272 (1):16-27.
Opposite effects of Ca2+ and GTP binding on tissue transglutaminase tertiary structure. Di Venere, A., Rossi, A., De Matteis, F., Rosato, N., Finazzi Agro', A. and Mei, G. J. Biol. Chem. (2000), 275: 3915-3921.
Probing the structure and mobility of Pseudomonas aeruginosa azurin by circular dichroism and dynamic fluorescence anisotropy. Mei, G.,Gilardi, G., Venanzi, M., Rosato, N., Canters, G. W. and Finazzi Agro', A. Protein Sci., 1996, 5: 2248-2254
CURRICULUM VITAE ET STUDIORUM
Dati Anagrafici
Data e luogo e data di nascita: Roma, 4 dicembre 1962
Recapito Ufficio/lab.: Tel. +39-06-72596471
e-mail. mei@med.uniroma2.it
Dip. di Medicina Sperimentale, Università "Tor Vergata", Via Montpellier, 1. Roma 00133
Studi e carriera universitaria
1987 Laurea in Fisica Università presso l’Università di Roma “La Sapienza” con votazione 110/110.
Titolo della tesi: “Studio della denaturazione proteica mediante fluorescenza dinamica”
Relatore: Prof. Giorgio Careri
1994-2004 Ricercatore universitario nel settore BIO/10 (Biochimica) presso la facoltà di Medicina dell'Università di Roma "Tor Vergata", Dipartimento di Medicina Sperimentale.
2004-2021 Professore Associato di Biochimica BIO/10 presso la facoltà di Medicina dell'Università di Roma "Tor Vergata", Dipartimento di Medicina Sperimentale..
2021-presente Professore Ordinario di Biochimica BIO/10 presso la facoltà di Medicina dell'Università di Roma "Tor Vergata", Dipartimento di Medicina Sperimentale.
Pubblicazioni scientifiche (aggiornato al 2023)
Giampiero Mei è autore di oltre 80 pubblicazioni su riviste internazionali.
Ente
H-index
# citazioni
# articoli
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28
2511
85
Scopus
24
1916
77
WOS
23
1872
78
Premi e Borse di Studio
1987-1994
All’inizio dell’attività universitaria, Giampiero Mei ha vinto varie borse di studio assegnategli da diversi enti, secondo la cronologia riportata in tabella.
anno
ente
note
1987
SIBBM Soc. Italiana Biofisica e Biologia Molecolare
Premio laurea 1987
1989-1990
Borsa di Studio Ministero Pubblica Istruzione
Attività prevista in un laboratorio estero (sede: LFD c/o Loomis Lab of Physics, University of Illinois, USA)
1990-1991
Borsa di studio CNR (Biotecnologie e Biostrument.)
Vincitore con punteggio 56/60
1991-1992
Borsa di studio CNR (Biotecnologie e Biostrument.)
Vincitore con punteggio 27/30
1992-1993
Borsa di studio CNR (Biotecnologie e Biostrument.)
Vincitore con punteggio 27.5/30
1993-1994
IDI, Istituto dermopatico dell’Immacolata
Incarico prestazione professionale, nell’ambito delle attività di ricerca del Laboratorio di Biologia della Cute
Incarichi universitari
- Nel 2016 è stato eletto rappresentante alla Giunta di Facoltà di Medicina e Chirurgia di Tor Vergata (incarico di durata triennale 2016-2019)
- Dal 2022 è nuovamente rappresentante alla Giunta di Facoltà di Medicina e Chirurgia di Tor Vergata
- Dal 2015 ad oggi coordina il corso di Biochimica della Facoltà di Medicina e Chirurgia di Tor Vergata.
Brevetti
Metodo utilizzabile nella misurazione della fluidità di membrane cellulari mediante l'intensita' di fluorescenza della sonda laurodan.
Rosato, N., Melino, G., Mei, G., Finazzi Agro', A. ;
Brevetto CNR 6/5/(1992) - n. RM92A000339.
Attività Didattica I: corso di Laurea in Medicina e Chirurgia
(Facoltà di Medicina e Chirurgia, “Tor Vergata”)
1994-presente: Biochimica nel CL di Medicina dell’Università di Roma Tor Vergata
1993-2018 Fisica, Biofisica, Analisi Matematica, Statistica e Biochimica a vari corsi di laurea triennali della Facoltà di Medicina e Chirurgia dell’Università di Roma Tor Vergata
Attività Didattica II: corso di Laurea Ciclo Unico in INGLESE
(Facoltà di Medicine and Surgery, “Tor Vergata”)
Il professor Mei ha insegnato Biochimica dal 2013 al 2015 nel CL di Medicina in Inglese dell’Università di Roma Tor Vergata
Attività Didattica III: corso di Laurea in Ingegneria Biomedica
(Facoltà di Ingegneria, “Tor Vergata”)
Il professor Mei ha tenuto i corsi di “Modellazione e simulazione di sistemi biologici” e “Strutture e dinamiche cellulari”dal 2000 al 2006 presso il CL di Ingegneria Biomedica dell’Università di Roma Tor Vergata
Attività Didattica IV: insegnamenti presso altri Atenei nazionali ed all’estero
anni
Insegnamento
Facoltà/CL
Università
c.f.u.
#studenti
note
2018-2019
2019-2020
Biochemistry
“Physiotherapy”
“Radiology”
UniCamillus,
Roma
UniCamillus, Roma
2
2
≈ 30
≈ 10
C.L. Triennale
in inglese
C.L. Triennale
in inglese
2013-2021
2014-2015
2015-2016
2016-2017
2017-2018
2018-2019
2019-2020
2020-2021
2021-2022
2022-2023
2023-2024
Biochimica
Medicina e
Chirurgia
Nostra Signora del
Buonconsiglio,
Tirana, Albania
4
4
4
4
4
5
5
5
5
5
5
≈ 200
2019-2020
Biochimica clinica
Biochimica applicata
Scuola
specializzazione
in Ortopedia
Scuola di
specializzazione
in Scienze
alimentazione
Nostra Signora
del Buonconsiglio,
Tirana, Albania
Nostra Signora del
Buonconsiglio,
Tirana, Albania
2
2
≈ 5
≈ 5
Libri di testo di Biochimica
Eserciziario di biochimica, 2017, PICCIN (in collaborazione con il Professor A. Rossi)
La Biochimica di Devlin Plus, 2023 (capitoli 6-8)
Partecipazione a scuole di dottorato
2002-2005 “Robotica ed innovazioni informatiche applicate alle Scienze Chirurgiche”
2006-presente "Biochimica e Biologia Molecolare"
Campi di attività scientifica
L’attività di ricerca di Giampiero Mei è focalizzata sullo studio del rapporto struttura/funzione delle proteine ed in particolare:
a. Stabilità conformazionale delle proteine
L’attività specifica in questo campo ha riguardato sia misure di folding/unfolding all’equilibrio, sia di processi di cinetica lenta (minuti), mediante tecniche spettroscopiche tra cui:
- l’Assorbanza, per la determinazione delle concentrazioni di proteine/enzimi in soluzione e del binding dei cofattori
- la Fluorescenza allo stato stazionario e la Fluorescenza dinamica, per la caratterizzazione delle strutture terziaria delle proteine;
- il Dicroismo Circolare, nel peptidico, per la struttura secondaria, e nel visibile, per la struttura terziaria e/o il legame con cofattori, di proteine ed enzimi;
- l’Anisotropia di Fluorescenza, per la determinazione della dinamica rotazionale di proteine ed enzimi in soluzione;
b. Comportamento strutturale e funzionale di enzimi sottoposti ad alte pressioni
Questa tecnica è stata applicata prevalentemente nel caso di enzimi multimerici per determinarne:
- Lo stato di associazione (equilibrio monomero-dimero, monomero-trimero, monomero-tetramero)
- La flessibilità conformazionale, in termini di variazione di volume dovuta a idratazione delle cavità idrofobiche, indotta da pressione idrostatica
c. Interazione proteine-membrane
Questi studi sono stati eseguiti usando membrane-modello e in particolare:
- large unilamellar vesicles, LUV, per misure spettroscopiche in cuvetta (infrarosso, dicroismo circolare, fluorescenza
- giant unilamellar vesicles , GUV, per misure mediante microscopia di fluorescenza
- brush border membranes
d. Caratterizzazione della dinamica conformazionale di proteine a basse concentrazioni
Questi studi sono stati realizzati mediante la microscopia a due fotoni, utilizzando la metodica FCS (Fluorescence Correlation Spectroscopy). Questa tecnica consente lo studio di “singola molecola”, individuando fluttuazioni nel segnale di fluorescenza di proteine localizzate nel solo volume di illuminazione (una-due decine di femtolitri), con concentrazioni tipicamente nanomolari e pre-marcate con fluorofori emittenti nel visibile.
Le proteine che sono state studiate con questa tecnica sono molto diverse, per forma (struttura terziaria), stato di associazione (struttura quaternaria), ruolo funzionale e collocazione cellulare:
- Ascorbato ossidasi (dimero, da zucchina)
- TRAF2 (TRF-associated factor, trimero, umana)
- GSTP1 (glutatione transferasi, dimero, umana)
- MALE (maltotriose-binding protein, monomero, da batterio termofilo)
e. Studio dell’interazione d’interfaccia proteina-proteina
Questa ricerca ha lo scopo di stabilire il ruolo che gioca la superficie di contatto tra due proteine nella regolazione delle variazioni conformazionali, stato associativo e funzione biologica di proteine e enzimi. La parte teorica è svolta in collaborazione con il Dipartimento di Fisica dell’Università di Tor Vergata (per le simulazioni di dinamica Molecolare) e con il Dipartimento di Chimica del Campus Biomedico di Roma (per l’analisi di Reti Di Contatto)
.
Fondi di ricerca di cui è stato titolare
anno
ente
titolo
finanziamento
note
2001
Progetto giovani ricercatori 2001
“Studio dei processi di aggregazione e misfolding di proteine oligomeriche”
4300000 lire
Responsabile del progetto (P.I.)
2008
Ministero Ricerca Scientifica
Progetto PRIN 2008
“Interazione dell’anandamide idrolasi (FAAH) con le membrane: come prendere substrati idrofobici e rilasciare prodotti idrofilici”
64116 euro
U.O. Tor Vergata
Responsabile Scientifico
U.O. Tor Vergata
2020
Università di Roma “Tor Vergta”
Progetto d’Ateneo Beyond Borders 2020
“Proteins on the edge: unraveling the protein-membrane interaction mechanism by a multidisciplinary approach”
15700 euro
Responsabile del progetto (P.I.)
2022
Ministero Ricerca Scientifica
Progetto PRIN 2022: Settore ERC LS1 “Molecules of Life: Biological Mechanisms, Structures and Functions”
194000 euro
Responsabile del progetto (P.I.)
Collaborazioni Scientifiche internazionali
1985-1990 Progetto Utilizzazione Luce di Sincrotrone (P.U.L.S.) Laboratori Nazionali di Frascati, Roma.
1989-1993 Laboratorio per la Fluorescenza Dinamica (L.F.D.) dell'Università dell'Illinois, USA, presso il gruppo del prof. Enrico Gratton.
1994-1996 Gruppo del Dr. Peter Steinert dei laboratori NIH, Bethesda, USA.
1990-1999 Collaborazione con il Prof. Gianfranco Gilardi presso il Dipartimento di Biochimica dell'Imperial College of Science, Technology and Medicine di Londra.
2008-Presente Collaborazione con il Prof. Hartmut Kuhn dell’università di Berlino Charitè, Facoltà di Medicina.
2019-Presente Collaborazione con il Dr. Igor Ivanov del “Lomonosov Institute of Fine Chemical Technologies” di Mosca.
Collaborazioni Scientifiche nazionali
A livello nazionale il Prof. Mei ha collaborato con i seguenti gruppi di ricerca:
Prof. Martino Bolognesi, Università di Pavia
Prof. sa Emilia Chiancone, Università di Roma, "La Sapienza"
Prof. Giorgio Ricci, Università di Roma, "Tor Vergata"
Prof. Alessandro Desideri, Università di Roma "Tor Vergata"
Dr.sa Tiziana Parasassi dell’Istituto di Medicina Sperimentale del CNR.
Dal 2015 ad oggi collabora con la Prof. Luisa Di Paola dell’Università Campus Biomedico di Roma
Dal 2019 ad oggi collabora con il gruppo del Prof. Alessandro Nucara dell’università La Sapienza di Roma
Permanenze di lavoro all’estero
Anno
Durata
Laboratorio
Titolo ricerca
1989
4 mesi
LFD, University Illinois, USA
Studio del folding di “copper proteins” (amicianina, azurina, superossido dismutasi)
1990
8 mesi
LFD, University Illinois, USA
Meccanismo di associazione/dissociazione dell’ascorbato ossidasi
1993
4 mesi
LFD, University Illinois, USA
Caratterizzazione della dinamica di trasferimento dello ione Fe2+/3+ all’interno della ferritina
Corsi di perfezionamento/aggiornamento
Nell'ottobre del 2006 ha frequentato la scuola di microscopia di fluorescenza avanzata presso l'Università di Irvine organizzata dal Professor Enrico Gratton all'LFD (Laboratory for Fluorescence Dynamics).
Capitoli di libri e raccolte scientifiche
Azurins and their site-directed mutants.
Mei, G., Rosato, N. and Finazzi Agrò, A.
In "Topics in Fluorescence Spectroscopy", Volume 6 (Edited by J.R. Lakowicz).
Plenum Press, New York, (2000), 67-81.
Fluorescence in protein science
Mei G.
In eLS. John Wiley & Sons, Ltd: Chichester. (December 2017)
The Puzzling Problem of Cardiolipin Membrane-Cytochrome c Interactions: A Combined Infrared and Fluorescence Study.
Ripanti, F., Di Venere, A., Cestelli Guidi, M., Romani, M, Filabozzi, A., Carbonaro, M., Piro, M.C., Sinibaldi, F., Alessandro Nucara, A., and Mei, G.
In “Prime Archives in Molecular Sciences: 2nd Edition” (2021)
La Biochimica di Devlin
Edises, 2023
Attività editoriale
Nell’arco di 30 anni, Giampiero Mei ha collaborato in qualità di reviewer con le seguenti riviste internazionali:
Journal Biological Chemistry, Biochemistry, Biophysical Chemistry, Journal Molecular Structure, Plos ONE, Biochimica Biophysica Acta, Biotechnology and Applied Biochemistry, Journal of Theoretical Biology, Entropy, Amino Acids Journal.
Dal 2020 fa parte del Topics Board Editor di International Journal of Molecular Sciences (IJMS) nella sezione “Molecular Biophysics”.
Nel 2021 è stato coordinatore in qualità di Guest Editor di un numero speciale di IJMS dal titolo: “Structural, Functional and Foldinf Strategies of Oligomeric Proteins”
Nel 2021 è stato coordinatore di un numero speciale di Symmetry dal titolo: “Symmetry in Protein Function and Structure”
Nome del Corso | Facoltà | Anno | ||
---|---|---|---|---|
12 | Biochimica | Medicina E Chirurgia | 2023/2024 | |
Modulo: Biochimica 1 | Medicina E Chirurgia | 2023/2024 | ||
Modulo: Biochimica 2 | Medicina E Chirurgia | 2023/2024 | ||
13 | Biochimica | Medicina E Chirurgia | 2022/2023 | |
Modulo: Biochimica 1 | Medicina E Chirurgia | 2022/2023 | ||
Modulo: Biochimica 2 | Medicina E Chirurgia | 2022/2023 | ||
10 | Biochimica | Medicina E Chirurgia | 2021/2022 | |
Modulo: Biochimica 1 | Medicina E Chirurgia | 2021/2022 | ||
Modulo: Biochimica 2 | Medicina E Chirurgia | 2021/2022 | ||
3 | Biochimica | Medicina E Chirurgia | 2020/2021 | |
Modulo: Biochimica 1 | Medicina E Chirurgia | 2020/2021 | ||
Modulo: Biochimica 2 | Medicina E Chirurgia | 2020/2021 | ||
0 | Biologia - Fisica Applicata - Biochimica | Medicina E Chirurgia | 2019/2020 | |
Modulo: Biofisica | Medicina E Chirurgia | 2019/2020 | ||
0 | Biologia, Fisica Applicata, Biochimica | Medicina E Chirurgia | 2019/2020 | |
Modulo: Fisica Applicata | Medicina E Chirurgia | 2019/2020 | ||
11 | Biochimica | Medicina E Chirurgia | 2019/2020 | |
Modulo: Biochimica 1 | Medicina E Chirurgia | 2019/2020 | ||
Modulo: Biochimica 2 | Medicina E Chirurgia | 2019/2020 | ||
0 | Biologia - Fisica Applicata - Biochimica | Medicina E Chirurgia | 2018/2019 | |
Modulo: Biofisica | Medicina E Chirurgia | 2018/2019 | ||
0 | Biologia, Fisica Applicata, Biochimica | Medicina E Chirurgia | 2018/2019 | |
Modulo: Fisica Applicata | Medicina E Chirurgia | 2018/2019 | ||
10 | Biochimica | Medicina E Chirurgia | 2021/2022 | |
Modulo: Biochimica 1 | Medicina E Chirurgia | 2021/2022 | ||
Modulo: Biochimica 2 | Medicina E Chirurgia | 2021/2022 |